โดย Nicoletta Lanese เผยแพร่เมื่อ 17 กุมภาพันธ์ 2021
ค้างคาวสีเหลืองเอเชียน้อย (Scotophilus kuhlii) (เครดิตภาพ: Shutterstock)
สัตว์เลี้ยงลูกด้วยนมหลายร้อยชนิดสามารถทําหน้าที่เว็บสล็อตเป็นศูนย์บ่มเพาะสําหรับ coronaviruses เพื่อผสมและจับคู่ซึ่งกันและกันซึ่งอาจสร้างไวรัสใหม่และกระตุ้นการระบาดในอนาคตการศึกษาใหม่คาดการณ์ สายพันธุ์เหล่านี้รวมถึงสัตว์ป่าเช่นค้างคาวและลิงรวมถึงสัตว์เลี้ยงเช่นหมูและแมว
การศึกษาที่ตีพิมพ์เมื่อวันที่ 16 กุมภาพันธ์ในวารสาร Nature Communications เน้นถึงศักยภาพ
ของ coronaviruses ที่จะติดเชื้อโฮสต์ที่หลากหลาย ในความเป็นจริงงานระบุสัตว์หลายร้อยชนิดที่อาจติดเชื้อ coronaviruses ที่รู้จักกันแม้ว่าการติดเชื้อเหล่านี้จํานวนมากยังไม่ได้รับการสังเกตในป่า
ไวรัสโคโรนาเป็นไวรัสในตระกูลใหญ่ที่สามารถติดเชื้อได้ทั้งนกและสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนม SARS-CoV-2 ไวรัสที่ทําให้เกิด COVID-19 เป็นเพียงสมาชิกคนหนึ่งของครอบครัว coronavirus สําหรับการวิจัยทีมงานได้ดึงลําดับทางพันธุกรรมของ coronaviruses 411 จาก GenBank ฐานข้อมูลสถาบันสุขภาพแห่งชาติและคัดกรองลําดับเหล่านี้โดยใช้อัลกอริทึมคอมพิวเตอร์ ลําดับแสดงถึงไวรัสโคโรนา 92 สายพันธุ์ที่แตกต่างกันโดยมีบางชนิดแสดงโดยสายพันธุ์ไวรัสมากกว่าหนึ่งสายพันธุ์
ที่เกี่ยวข้อง: 20 ของโรคระบาดที่เลวร้ายที่สุดและการระบาดใหญ่ในประวัติศาสตร์
อัลกอริทึมคาดการณ์ว่าโดยเฉลี่ยแล้วไวรัสแต่ละตัวมีโฮสต์ของสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนมมากกว่า 12 ตัว ในทางกลับกันสัตว์ที่คัดกรองแต่ละชนิดถูกคาดการณ์ว่าเป็นโฮสต์ที่มีศักยภาพมากกว่าห้า coronaviruses โดยเฉลี่ยสัตว์ที่สามารถทําหน้าที่เป็นเจ้าภาพสําหรับ coronaviruses จํานวนมากนําเสนอภัยคุกคามที่ใหญ่ที่สุด เมื่อไวรัสโคโรนาหลายสายพันธุ์บุกเซลล์เดียวกันยีนของพวกเขาสามารถผสมและจับคู่ได้ขณะที่พวกเขาทําซ้ําจึงสร้างไวรัสใหม่ที่ปะติดปะต่อกัน
การสับเปลี่ยนการ์ดพันธุกรรมนี้หรือที่เรียกว่า “การรวมใหม่” อาจเป็นอันตรายอย่างยิ่งหาก SARS-CoV-2 สลับยีนกับ coronavirus อื่นผู้เขียนเขียน นั่นเป็นเพราะไวรัสที่เกิดขึ้นอาจติดเชื้อต่อมนุษย์เช่น SARS-CoV-2 แต่อาจบุกรุกเนื้อเยื่อเพิ่มเติมหรือทําให้เกิดโรคที่รุนแรงมากขึ้น แบบจําลองระบุ 126 สายพันธุ์ที่ไม่ใช่มนุษย์ที่อาจโฮสต์ SARS-CoV-2 และ coronavirus อื่น ๆ อย่างน้อยหนึ่งตัวซึ่งอาจทําให้สถานการณ์ที่น่าหนักใจนี้คลี่คลาย
”น่าแปลกใจกว่าสัตว์แต่ละตัวคือสัตว์หลากหลายชนิดที่คาดการณ์ว่าเป็นเจ้าภาพของ coronaviruses
จํานวนมาก” ผู้เขียนการศึกษา Maya Wardeh นักวิทยาศาสตร์ข้อมูลและ Marcus Blagrove นักไวรัสวิทยาของมหาวิทยาลัยลิเวอร์พูลในอังกฤษเขียนในแถลงการณ์ร่วมต่อ Live Science “ทุกคนรู้ว่าค้างคาวมีความสําคัญ แต่เราพบโฮสต์ที่มีความเสี่ยงสูงจํานวนมากทั่วสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนมรวมถึงสัตว์ฟันแทะสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนม [และ] กีบ”ที่กล่าวว่าเพียงเพราะ coronaviruses สองตัวสามารถรุกรานสัตว์ตัวเดียวกันได้ไม่ได้หมายความว่าพวกเขาสามารถและจะรวมตัวอีกครั้ง Arinjay Banerjee นักไวรัสวิทยาที่มหาวิทยาลัย McMaster ในออนแทรีโอซึ่งไม่ได้มีส่วนร่วมในการศึกษา การรวมตัวกันใหม่กําหนดให้ไวรัสเข้าสู่เซลล์ชนิดเดียวกันและการติดเชื้อจะสูงสุดในเวลาเดียวกันในหมู่โลจิสติกส์อื่น ๆ เขากล่าวว่า แต่การศึกษาใหม่ให้รายการที่มีประโยชน์ของสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนมที่ควรได้รับการตรวจสอบสําหรับการติดเชื้อ coronavirus และเหตุการณ์การรวมตัวในอนาคตเขากล่าวว่า
เครือข่ายของการติดเชื้อที่อาจเกิดขึ้น เพื่อคาดการณ์ว่าสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนมชนิดใดน่าจะเป็นโฮสต์ coronavirus ผู้เขียนได้สร้างอัลกอริทึมคอมพิวเตอร์ที่แมปการเชื่อมต่อระหว่างโฮสต์ที่มีศักยภาพและ coronaviruses ที่รู้จัก อัลกอริทึมวิเคราะห์ coronaviruses ที่รู้จักและดูว่าสัตว์ใดที่พวกเขารู้จักติดเชื้อ จากนั้นก็มองไปที่สัตว์อื่น ๆ ที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดอาศัยอยู่ในที่อยู่อาศัยที่คล้ายกันหรือกินอาหารประเภทเดียวกันเนื่องจากพวกเขามีแนวโน้มที่จะสงสัยว่าจะมีประชากร coronavirus ที่คล้ายกัน อัลกอริทึมยังเปรียบเทียบลําดับจีโนมของ coronaviruses ที่แตกต่างกันด้วยความคิดที่ว่า coronaviruses ที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดน่าจะสามารถติดเชื้อโฮสต์ที่คล้ายกันได้หลังจากพบการเชื่อมต่อเหล่านี้อัลกอริทึมที่ระบุว่าสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนมชนิดใดที่สามารถเก็บ coronaviruses จํานวนมากและดังนั้นจึงเป็นแหล่งรวมของ coronavirus
ทีมคัดกรองสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนม 876 ชนิดโดยใช้อัลกอริทึมนี้รวมถึงโฮสต์ coronavirus ที่รู้จักกัน 185 แห่ง ส่วนที่เหลืออีก 691 ชนิดเป็นของสกุลเดียวกับโฮสต์ที่รู้จัก อัลกอริทึมทดสอบการเชื่อมโยงที่อาจเกิดขึ้นระหว่างสัตว์เหล่านี้และ coronaviruses 411 ซึ่งทราบลําดับ RNA ที่สมบูรณ์แล้ว ”ไวรัส 411 ชนิดนี้มีไวรัสโคโรนาทั้ง 7 ชนิดที่รู้จักกันในการติดเชื้อในมนุษย์ รวมถึงไวรัสโคโรนาชนิดอื่น ๆ ที่จีโนมได้รับลําดับอย่างเต็มรูปแบบ” ในขณะที่สายพันธุ์ที่เรียงลําดับทั้งหมดของ SARS-CoV-2 รวมอยู่ในการวิเคราะห์พวกเขาได้รับการปฏิบัติเป็นหน่วยงานเดียวในการวิเคราะห์ “ตัวแปร SARS-CoV-2 มีความคล้ายคลึงกันมากโดยมีการกลายพันธุ์เพียงเล็กน้อยเท่านั้น เราจะไม่คาดหวังว่าผลลัพธ์ของเราสําหรับความจําเพาะของโฮสต์จะแตกต่างกันมากระหว่างพวกเขา” ผู้เขียนบอกกับ Live Scienceเว็บสล็อต